132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3734 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  100 
 
 
496 aa  1039    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  66.53 
 
 
496 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  62.12 
 
 
498 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  58.78 
 
 
495 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  59.76 
 
 
503 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  59.55 
 
 
503 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  59.55 
 
 
503 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  59.55 
 
 
503 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  60.12 
 
 
494 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  58.69 
 
 
510 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  58.18 
 
 
500 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  58.9 
 
 
740 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  56.79 
 
 
523 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  54.92 
 
 
505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  57.29 
 
 
492 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  54.27 
 
 
503 aa  597  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  53.67 
 
 
497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  49.9 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49 
 
 
504 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  51.2 
 
 
499 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  51.2 
 
 
499 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  51.2 
 
 
499 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  50.1 
 
 
496 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  47.5 
 
 
509 aa  518  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.6 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  50.1 
 
 
506 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  46.51 
 
 
510 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  48.8 
 
 
507 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  46.6 
 
 
506 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  46.48 
 
 
502 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  45.18 
 
 
500 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  48.58 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.56 
 
 
501 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  45.25 
 
 
509 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  48.07 
 
 
503 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  48.17 
 
 
497 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  46.37 
 
 
501 aa  477  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  47.7 
 
 
498 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  44.93 
 
 
497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  44.33 
 
 
505 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  45.65 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.65 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  45.29 
 
 
501 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  44.58 
 
 
504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  44.61 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  43.26 
 
 
518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  44.85 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.37 
 
 
511 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  44.15 
 
 
507 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  41.88 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  43.03 
 
 
503 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  41.83 
 
 
505 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  40.12 
 
 
501 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  39.72 
 
 
501 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.72 
 
 
515 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  39.4 
 
 
504 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.3 
 
 
499 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.74 
 
 
538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.55 
 
 
538 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.55 
 
 
538 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.35 
 
 
538 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  35.53 
 
 
538 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.15 
 
 
538 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.55 
 
 
537 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.51 
 
 
529 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.2 
 
 
529 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.9 
 
 
481 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.98 
 
 
532 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  35.68 
 
 
502 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.93 
 
 
506 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  32.75 
 
 
524 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
517 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.23 
 
 
507 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  31.71 
 
 
522 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.99 
 
 
508 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.17 
 
 
505 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.49 
 
 
508 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.96 
 
 
508 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
508 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.96 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  31.33 
 
 
526 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  32.61 
 
 
513 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  31.2 
 
 
508 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  32.61 
 
 
513 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  32.61 
 
 
513 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  31.9 
 
 
508 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.32 
 
 
507 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.2 
 
 
517 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.02 
 
 
524 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.1 
 
 
527 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  30.78 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  32.31 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  30.51 
 
 
528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.41 
 
 
515 aa  220  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  29.53 
 
 
507 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  30.06 
 
 
510 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  30.74 
 
 
514 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  33.97 
 
 
518 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  29.55 
 
 
513 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>