136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2037 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  66.4 
 
 
497 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  68.8 
 
 
507 aa  736    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  100 
 
 
499 aa  1041    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  97.8 
 
 
499 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  98 
 
 
499 aa  1022    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  56.25 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  53.43 
 
 
500 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  53.36 
 
 
506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  52.75 
 
 
496 aa  555  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  51.2 
 
 
500 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.72 
 
 
504 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  51.11 
 
 
502 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  51.72 
 
 
498 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  51.53 
 
 
505 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  51.62 
 
 
509 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  50.1 
 
 
495 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
503 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  50.51 
 
 
503 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  50.91 
 
 
494 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  51.2 
 
 
496 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  52.93 
 
 
496 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  51.12 
 
 
503 aa  521  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  49.19 
 
 
510 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  50.71 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  51.53 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  49.49 
 
 
497 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  48.31 
 
 
740 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  48.88 
 
 
498 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  48.3 
 
 
510 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  48.88 
 
 
497 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.99 
 
 
509 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  47.97 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  47.98 
 
 
501 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  48.28 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  50.3 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  48.48 
 
 
504 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  47.76 
 
 
501 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  47.47 
 
 
492 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  47.26 
 
 
505 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.27 
 
 
507 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  48.27 
 
 
523 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  47.11 
 
 
502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  46.36 
 
 
512 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  45.7 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.47 
 
 
518 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  47.18 
 
 
511 aa  445  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  45.05 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.83 
 
 
502 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  44.49 
 
 
503 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  44.98 
 
 
501 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.71 
 
 
511 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  44.42 
 
 
501 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.31 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  43.15 
 
 
505 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
504 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.72 
 
 
499 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  36.69 
 
 
538 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.5 
 
 
538 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  39.17 
 
 
538 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  36.19 
 
 
538 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  39.17 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  39.17 
 
 
538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  37.26 
 
 
537 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  36.17 
 
 
517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  35.44 
 
 
522 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  36.22 
 
 
529 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  36.22 
 
 
529 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33 
 
 
481 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  35.21 
 
 
532 aa  259  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  36.99 
 
 
524 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  37.39 
 
 
508 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 
502 aa  256  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.87 
 
 
498 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  38.17 
 
 
526 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  33.59 
 
 
513 aa  250  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.86 
 
 
499 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
507 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  34.82 
 
 
507 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  34.79 
 
 
514 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  35.36 
 
 
517 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  39.58 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.73 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  34.08 
 
 
537 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  34.69 
 
 
524 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
501 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.88 
 
 
514 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  36.31 
 
 
524 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.6 
 
 
501 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.01 
 
 
503 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  34.05 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  35.07 
 
 
508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.66 
 
 
505 aa  240  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.14 
 
 
522 aa  240  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.78 
 
 
508 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  34.29 
 
 
518 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.07 
 
 
505 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  36.23 
 
 
527 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
508 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>