128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1176 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  59.63 
 
 		 494 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  59.55 
 
 		 496 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  80 
 
 		 500 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  64.14 
 
 		 740 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  61.99 
 
 		 496 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  63.73 
 
 		 498 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  64.27 
 
 		 492 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  83.33 
 
 		 495 aa  890    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  99.6 
 
 		 503 aa  1051    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  99.8 
 
 		 503 aa  1053    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  100 
 
 		 503 aa  1054    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  99.6 
 
 		 503 aa  1052    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  58.2 
 
 		 510 aa  630  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  57.43 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  57.87 
 
 		 503 aa  621  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  56.67 
 
 		 523 aa  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  55.94 
 
 		 497 aa  588  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  51.31 
 
 		 502 aa  544  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  51.85 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.51 
 
 		 499 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  50.51 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.51 
 
 		 499 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  49.9 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  48.38 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  47.42 
 
 		 509 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  50.91 
 
 		 497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  48.66 
 
 		 497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  47.88 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  50.5 
 
 		 498 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  50.2 
 
 		 503 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  48.7 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  49.11 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  48.96 
 
 		 497 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.69 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  47.41 
 
 		 502 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  48.19 
 
 		 501 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  46.86 
 
 		 504 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.46 
 
 		 505 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.15 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  45.78 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  44.96 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  47.7 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  44.99 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  44.09 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  44.9 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  43.57 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.77 
 
 		 518 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  45.02 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  44.04 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  42.05 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.03 
 
 		 504 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  41.37 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  41.58 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  38.59 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.26 
 
 		 538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.45 
 
 		 538 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.45 
 
 		 538 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.82 
 
 		 538 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.87 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  35.38 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.75 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.98 
 
 		 502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.71 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  30.35 
 
 		 481 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 508 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.07 
 
 		 532 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.55 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  37.62 
 
 		 508 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  32.76 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 507 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  32.28 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  32.06 
 
 		 513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.91 
 
 		 498 aa  226  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.97 
 
 		 526 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  31.5 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 524 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 513 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  30.78 
 
 		 508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  30.54 
 
 		 507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 513 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 515 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 531 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  32.35 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>