124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1078 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  100 
 
 
513 aa  1074    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  98.83 
 
 
513 aa  1062    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  98.83 
 
 
513 aa  1063    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  48.93 
 
 
508 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  46.3 
 
 
507 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  45.79 
 
 
508 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  45.29 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  47.75 
 
 
508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  45.29 
 
 
507 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  45.16 
 
 
518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  45.05 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  43.5 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  43.1 
 
 
522 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  43.07 
 
 
537 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  43.91 
 
 
514 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  41.94 
 
 
508 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  41.87 
 
 
524 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  42.69 
 
 
524 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  43.22 
 
 
524 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  43.3 
 
 
517 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  40.31 
 
 
525 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  42.86 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  39.81 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.07 
 
 
532 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  40.53 
 
 
513 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  42.46 
 
 
507 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  40.84 
 
 
527 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  44.11 
 
 
507 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  38.65 
 
 
543 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  39.66 
 
 
543 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  42.57 
 
 
515 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  38.84 
 
 
543 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  38.65 
 
 
543 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  40.37 
 
 
531 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  42.18 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40 
 
 
520 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40.85 
 
 
522 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  39.63 
 
 
537 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  41.7 
 
 
511 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  37.96 
 
 
517 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  41.3 
 
 
505 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  37.72 
 
 
520 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  36.7 
 
 
529 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  37.53 
 
 
529 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.49 
 
 
498 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.99 
 
 
508 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.46 
 
 
508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.06 
 
 
505 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
538 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
538 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.86 
 
 
538 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.86 
 
 
538 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.86 
 
 
538 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.31 
 
 
497 aa  257  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
537 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  36.7 
 
 
503 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.55 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  32.04 
 
 
512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  35.42 
 
 
497 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  36.23 
 
 
496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.07 
 
 
509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  31.96 
 
 
505 aa  236  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.77 
 
 
506 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.81 
 
 
502 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.13 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.18 
 
 
501 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.88 
 
 
504 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.64 
 
 
517 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.59 
 
 
507 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.71 
 
 
501 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.64 
 
 
501 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.18 
 
 
495 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.75 
 
 
494 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.61 
 
 
496 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.55 
 
 
523 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.74 
 
 
504 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  35.81 
 
 
740 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.05 
 
 
510 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
501 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.12 
 
 
506 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.07 
 
 
500 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
503 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.68 
 
 
499 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
511 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.16 
 
 
501 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.56 
 
 
501 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.86 
 
 
499 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  34.46 
 
 
502 aa  223  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.84 
 
 
499 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.48 
 
 
499 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
502 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.15 
 
 
518 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
503 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
503 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
505 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
503 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.19 
 
 
503 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  32.19 
 
 
502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.46 
 
 
503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>