125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2404 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2363  tryptophan halogenase  72.16 
 
 		 802 aa  1091    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2404  tryptophan halogenase  100 
 
 		 806 aa  1579    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  32.12 
 
 		 509 aa  223  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 501 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  28.66 
 
 		 502 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  27.13 
 
 		 503 aa  210  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  30.4 
 
 		 515 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  31.02 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  28.92 
 
 		 496 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  28.18 
 
 		 512 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  26.31 
 
 		 494 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  26.42 
 
 		 504 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  31.15 
 
 		 518 aa  201  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.73 
 
 		 505 aa  201  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  29.31 
 
 		 504 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.01 
 
 		 509 aa  197  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  27.04 
 
 		 510 aa  197  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  30.12 
 
 		 501 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  26.97 
 
 		 498 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  30.59 
 
 		 504 aa  194  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  29.5 
 
 		 502 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  31.57 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  29.76 
 
 		 497 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  27.68 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  28.17 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  27.9 
 
 		 499 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  30.43 
 
 		 506 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  27.08 
 
 		 492 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  27.64 
 
 		 499 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  26.16 
 
 		 496 aa  187  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  28.15 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  29.84 
 
 		 505 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  25.2 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 511 aa  183  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  23.26 
 
 		 511 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  26.16 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  24.8 
 
 		 497 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  30.2 
 
 		 501 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  29.22 
 
 		 501 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  27.86 
 
 		 502 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  27.69 
 
 		 510 aa  178  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  26.42 
 
 		 497 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  25.65 
 
 		 503 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  25.4 
 
 		 503 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  26.51 
 
 		 496 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  25.45 
 
 		 503 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  25.25 
 
 		 503 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  28.19 
 
 		 497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  27.9 
 
 		 740 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  24.7 
 
 		 507 aa  173  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  31.2 
 
 		 502 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  30.56 
 
 		 503 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  29.78 
 
 		 505 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  25.85 
 
 		 501 aa  171  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  25.58 
 
 		 505 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  28.69 
 
 		 505 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  26.1 
 
 		 501 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  24.9 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  25.33 
 
 		 513 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  25.53 
 
 		 513 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  26.2 
 
 		 503 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  29.3 
 
 		 497 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  25.29 
 
 		 513 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  26 
 
 		 499 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  25.89 
 
 		 501 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  28.92 
 
 		 532 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  25.89 
 
 		 538 aa  151  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  26.58 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  26.82 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  26.82 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  24.86 
 
 		 529 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  26.71 
 
 		 529 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  26.82 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  28.43 
 
 		 502 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  25.82 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  25.43 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  28.05 
 
 		 508 aa  149  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  31.53 
 
 		 522 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  26.91 
 
 		 499 aa  147  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  26.98 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  27.31 
 
 		 508 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  26.14 
 
 		 537 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  24.76 
 
 		 498 aa  141  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  27.2 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  28.64 
 
 		 505 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  25.57 
 
 		 524 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  28.38 
 
 		 524 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  28.22 
 
 		 514 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  23.24 
 
 		 508 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  25.11 
 
 		 543 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  23.68 
 
 		 505 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  25.64 
 
 		 543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  24.89 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  25.7 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  24.36 
 
 		 506 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  25.39 
 
 		 507 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  23.48 
 
 		 508 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  22.09 
 
 		 507 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>