112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0993 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 696 aa  1425    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  27.87 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 515 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.07 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.65 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.88 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  26.97 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  24.04 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.18 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.59 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.49 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 549 aa  67.8  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.36 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 606 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  21.85 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  23.4 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  23.4 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.44 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  22.47 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.63 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  24.06 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 549 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.11 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  25.18 
 
 		 584 aa  61.6  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  23.63 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.55 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  21.77 
 
 		 429 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  21.93 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  21.93 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  22.52 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.68 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  22.22 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  22.22 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  20.27 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  26.43 
 
 		 414 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  21.88 
 
 		 420 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  25.84 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 566 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  21.16 
 
 		 429 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  24.69 
 
 		 429 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  22.73 
 
 		 415 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.1 
 
 		 444 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  20.05 
 
 		 435 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  23.44 
 
 		 566 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  23.44 
 
 		 566 aa  55.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  23.44 
 
 		 566 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  20.63 
 
 		 435 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  20.05 
 
 		 435 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.23 
 
 		 420 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  20.69 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  23.77 
 
 		 507 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  20.69 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  23.74 
 
 		 415 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  23.22 
 
 		 413 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  20.69 
 
 		 429 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  72.73 
 
 		 415 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  54.17 
 
 		 415 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  54.17 
 
 		 415 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  20.73 
 
 		 424 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  20.83 
 
 		 424 aa  50.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  21.15 
 
 		 491 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  21.32 
 
 		 417 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1309  monooxygenase FAD-binding protein  21.63 
 
 		 576 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.16 
 
 		 376 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  23.7 
 
 		 495 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.37 
 
 		 409 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  42.42 
 
 		 428 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  22.68 
 
 		 398 aa  48.5  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.78 
 
 		 401 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  24.36 
 
 		 419 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.18 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  20.63 
 
 		 563 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.3 
 
 		 409 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  23.4 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 375 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 555 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  51.16 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 524 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  43.08 
 
 		 367 aa  45.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  23.42 
 
 		 618 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1071  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.4 
 
 		 408 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719385  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 375 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 375 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 375 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  40.38 
 
 		 440 aa  44.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>