123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2735 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  99.82 
 
 
566 aa  1188    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  93.64 
 
 
566 aa  1120    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  94.52 
 
 
566 aa  1132    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  99.65 
 
 
566 aa  1187    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  100 
 
 
566 aa  1189    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  94.17 
 
 
566 aa  1124    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  95.23 
 
 
566 aa  1137    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 
549 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
549 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  44.71 
 
 
552 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  44.71 
 
 
552 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  44.71 
 
 
573 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  44.71 
 
 
552 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  44.71 
 
 
552 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  44.53 
 
 
552 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  44.53 
 
 
552 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
563 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
606 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2072  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
511 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.76 
 
 
449 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.45 
 
 
455 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.86 
 
 
455 aa  98.6  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.16 
 
 
444 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.5 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.36 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.19 
 
 
439 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.19 
 
 
439 aa  90.1  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.96 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.43 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.14 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.05 
 
 
618 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  25.56 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.73 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.73 
 
 
435 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.01 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.91 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.5 
 
 
409 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.14 
 
 
424 aa  77  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.12 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  23 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.58 
 
 
436 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
419 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
429 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  22.22 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.25 
 
 
419 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.1 
 
 
441 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.53 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  23.08 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.02 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  23.16 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  23.8 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.22 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.04 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.11 
 
 
415 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.19 
 
 
495 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  24.56 
 
 
449 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
416 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  23.86 
 
 
480 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.15 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  22.73 
 
 
470 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 
413 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  21.87 
 
 
414 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.44 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.06 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.63 
 
 
416 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  23.53 
 
 
415 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  25.71 
 
 
507 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  23.14 
 
 
491 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  28.11 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  28.43 
 
 
474 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 
696 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.39 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  22.1 
 
 
429 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  22.22 
 
 
568 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  21.98 
 
 
415 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.42 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.92 
 
 
401 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  21.95 
 
 
538 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  21.95 
 
 
538 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  19.95 
 
 
540 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  22.59 
 
 
507 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  25 
 
 
499 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  25.25 
 
 
499 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  23.42 
 
 
506 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  21.95 
 
 
538 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  21.86 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  22.89 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  24.41 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  23.78 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  23.78 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 
368 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  23.24 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  23.78 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>