104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5928 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 515 aa  1062    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  42.57 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  41.58 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1309  monooxygenase FAD-binding protein  41.21 
 
 		 576 aa  345  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 696 aa  100  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.86 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  25.33 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  26.36 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.49 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.19 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.79 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.62 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.94 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.19 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 		 429 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.35 
 
 		 417 aa  87  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.93 
 
 		 429 aa  87  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 		 429 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  23.81 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  25.14 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.69 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.69 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.66 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.93 
 
 		 449 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.63 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.67 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.35 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  25.36 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  24.17 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  24.03 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  26.99 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.06 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  27.2 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.95 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  25.19 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.81 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.65 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  27.43 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  26.22 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  26.22 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  26.22 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.23 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.6 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  22.38 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.8 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.96 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  24.01 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.87 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  25.07 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  23.48 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  23.39 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  21.63 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  23.12 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  23.68 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  22.59 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.56 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.27 
 
 		 584 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  22.64 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 549 aa  57  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  21.43 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  21.69 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  21.16 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  21.16 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  21.69 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  21.69 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  22.22 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  25.62 
 
 		 618 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 606 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  22 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  23.74 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  24.78 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 455 aa  47  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  23.74 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.38 
 
 		 384 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  23.74 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  23.74 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  23.29 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  23.29 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  23.29 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  22.16 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>