143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2100 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 367 aa  721    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  48.89 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  37.08 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  37.08 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.87 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.16 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.41 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.01 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.16 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.4 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  31.08 
 
 		 447 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.47 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 512 aa  50.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  47.73 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  25.99 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  26.26 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  26.26 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 511 aa  46.6  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  40.91 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  27.24 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 		 428 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  48.98 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0993  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  41.43 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.5 
 
 		 460 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  52.17 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  34.67 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.65 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  40.43 
 
 		 518 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  51.02 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>