205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0101 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 426 aa  881    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  45.16 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  42.97 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.16 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.73 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.73 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.61 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.16 
 
 		 367 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.34 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.26 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  29.14 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  34.21 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 496 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.55 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.28 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  33.55 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 965 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  30.62 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  26.18 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.62 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  23.95 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 374 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 436 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  23.39 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  32.69 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.39 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  23.39 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.17 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  30.51 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.17 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.29 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.17 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.92 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  26.25 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.5 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 378 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>