113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2008 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  97.58 
 
 		 372 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  67.83 
 
 		 373 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  65.5 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  62.73 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  61.46 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  58.42 
 
 		 380 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.55 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.86 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.91 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.32 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.36 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.77 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.77 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  24.93 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.05 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.95 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.76 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.63 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.63 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.63 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23.5 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.63 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.14 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.14 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.85 
 
 		 822 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.39 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.69 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.51 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.72 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  25.69 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  21.65 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.47 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.47 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.47 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2176  hypothetical protein  22.88 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.491905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  32.32 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>