130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4839 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 380 aa  789    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  60 
 
 		 381 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  42.97 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.61 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.53 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.53 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.65 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.92 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.76 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.47 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  28.49 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  24.35 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.93 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  33.55 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  30.77 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  42.37 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  35.19 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.71 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  24.49 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.41 
 
 		 496 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  23.64 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 799 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  24.41 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.81 
 
 		 644 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 823 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  27.81 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  26.95 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 965 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  23.33 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  32.26 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.78 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>