147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6735 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
387 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  57.57 
 
 
371 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 
377 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  38.32 
 
 
372 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.79 
 
 
380 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 
387 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  38.01 
 
 
407 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  38.01 
 
 
407 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.55 
 
 
426 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.85 
 
 
381 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.27 
 
 
383 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  36.14 
 
 
367 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
370 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.17 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30 
 
 
380 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
372 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  32.86 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  31.58 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
431 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
462 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  24.81 
 
 
480 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.4 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.4 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
442 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  38.38 
 
 
512 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  31.47 
 
 
447 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
447 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
500 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
435 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
500 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
983 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
451 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 
368 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
456 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
456 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.83 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.83 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.82 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  22.31 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
475 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
423 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.66 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.74 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.89 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
456 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.79 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
496 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
465 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
984 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
460 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
472 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  33.02 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
536 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.44 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
439 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
576 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 
482 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 
465 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
799 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8831  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
402 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276493  hitchhiker  0.00295943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.89 
 
 
369 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
446 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 
468 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  20.38 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  44.68 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  44.44 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>