72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5636 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 370 aa  740    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  61.5 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  62.73 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  58.95 
 
 		 380 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.66 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.72 
 
 		 426 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.82 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.82 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.22 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.5 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.92 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.96 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.92 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.4 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.17 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.17 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.17 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.49 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.73 
 
 		 434 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.88 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.49 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.49 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 960 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.06 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.02 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.02 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.02 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  24.4 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 428 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.21 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  33.96 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  21.18 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.91 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  38.67 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  24.63 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 386 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0194  putative sarcosine oxidase  26.39 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>