134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1302 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 380 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  66.58 
 
 		 371 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  61.84 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  59.21 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  58.95 
 
 		 370 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  58.42 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  57.89 
 
 		 372 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.99 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.69 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.69 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.47 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.26 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.47 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.14 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.46 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.65 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.35 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  24.8 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  24.93 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  24.93 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  24.87 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  23.31 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  25.46 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  25.75 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  26.84 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  22.95 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  20.23 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 983 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  27.9 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.38 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  29.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 496 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  19.14 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  21.34 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  21.84 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>