More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1221 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  98.8 
 
 
415 aa  799    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 
415 aa  811    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1822  D-amino-acid dehydrogenase  64.82 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  47.2 
 
 
419 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1756  D-amino-acid dehydrogenase  45.84 
 
 
419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.141509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  46.63 
 
 
417 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1987  D-amino-acid dehydrogenase  46.15 
 
 
408 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4949  D-amino-acid dehydrogenase  43.53 
 
 
423 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  40.7 
 
 
463 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  37.33 
 
 
433 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  37.33 
 
 
433 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  39.68 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  38.01 
 
 
438 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  36.64 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  37.68 
 
 
424 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1877  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
429 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000325686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  37.26 
 
 
421 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.39 
 
 
416 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.76 
 
 
416 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.63 
 
 
419 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.2 
 
 
434 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.83 
 
 
416 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.96 
 
 
434 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.96 
 
 
434 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  30.71 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.04 
 
 
433 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.54 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2852  D-amino-acid dehydrogenase  37.12 
 
 
455 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.73 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.66 
 
 
416 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.2 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.66 
 
 
416 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.02 
 
 
434 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 
428 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 
432 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
418 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.62 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.33 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.15 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.2 
 
 
416 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.23 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  33.74 
 
 
433 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.18 
 
 
432 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 
425 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.18 
 
 
432 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 
416 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.95 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.55 
 
 
428 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
434 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
434 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.95 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
434 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.55 
 
 
428 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.55 
 
 
428 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.39 
 
 
433 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.55 
 
 
428 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  31.74 
 
 
434 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.95 
 
 
432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.55 
 
 
428 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
432 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32 
 
 
417 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.54 
 
 
421 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.31 
 
 
428 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.31 
 
 
428 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  34.83 
 
 
416 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 
432 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.65 
 
 
432 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  34.04 
 
 
417 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 
416 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  34.12 
 
 
419 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
417 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32 
 
 
417 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  29.05 
 
 
417 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0740  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.88 
 
 
434 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.968608  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.7 
 
 
436 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.4 
 
 
434 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.36 
 
 
432 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.7 
 
 
436 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.01 
 
 
441 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.3 
 
 
433 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0944  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 
428 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972933  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0940  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.93 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1938  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6164  D-amino-acid dehydrogenase  35.41 
 
 
433 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1915  D-amino-acid dehydrogenase  35.41 
 
 
433 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>