More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1822 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1822  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2587  D-amino-acid dehydrogenase  66.02 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1221  D-amino-acid dehydrogenase  64.82 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2597  D-amino-acid dehydrogenase  48.32 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  46.41 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1756  D-amino-acid dehydrogenase  46.41 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.141509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1987  D-amino-acid dehydrogenase  47.61 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1981  D-amino-acid dehydrogenase  41.58 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4949  D-amino-acid dehydrogenase  44.1 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1877  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000325686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3504  D-amino-acid dehydrogenase  36.53 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  36.26 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0309  D-amino-acid dehydrogenase  37.1 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  36.49 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  36.49 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0369  D-amino-acid dehydrogenase  36.49 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3589  D-amino-acid dehydrogenase  36.26 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0959455  hitchhiker  0.00000935542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2852  D-amino-acid dehydrogenase  38.51 
 
 		 455 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2082  D-amino-acid dehydrogenase  32.07 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.44 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.17 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.82 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.62 
 
 		 421 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 432 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.52 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.1 
 
 		 416 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3630  D-amino-acid dehydrogenase  32.31 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.02 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 		 434 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.71 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1503  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.03 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.839298  normal  0.265321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.04 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.9 
 
 		 434 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.74 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.74 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.35 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  34.2 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  32.38 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.83 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.78 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.95 
 
 		 432 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.43 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 418 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.62 
 
 		 419 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.65 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.88 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.38 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  32.22 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.7 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.19 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.63 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.43 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.63 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.57 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  33.95 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0944  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.77 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  30.91 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0791  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.22 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.65 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6164  D-amino-acid dehydrogenase  33.97 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0940  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.52 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1915  D-amino-acid dehydrogenase  33.97 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>