239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3818 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 373 aa  738    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  67.83 
 
 		 372 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  67.56 
 
 		 372 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  59.95 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  59.21 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  61.5 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  60.48 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.32 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.15 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.32 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.97 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.62 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.01 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.66 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.66 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.85 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.08 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.27 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 984 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 983 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.38 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.54 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.37 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  26.25 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.25 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.8 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.79 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 823 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  23.38 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  23.38 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.77 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  23.38 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  21 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.34 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>