255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3401 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 383 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.61 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.27 
 
 		 372 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.65 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.88 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.88 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.23 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.99 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.01 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.32 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  28.08 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 816 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  25.48 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  23.04 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.14 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  23.81 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 823 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  24.66 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.32 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.12 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.67 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.57 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.12 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  29.44 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 812 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 479 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  22.27 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.19 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.65 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.65 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  25.22 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  25.22 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 816 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  26.01 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  20.14 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  24.65 
 
 		 473 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  24.65 
 
 		 489 aa  53.1  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.51 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1211  oxidoreductase  22.79 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 799 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.39 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  26.46 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.19 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  23.3 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 815 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  26.17 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  22.75 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 500 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  21.82 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  43.1 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.44 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 960 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 983 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 500 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1209  oxidoreductase  22.33 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  29.44 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  24.88 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1370  hypothetical protein  21.86 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0253561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>