113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1318 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
371 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  72.51 
 
 
371 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  61.84 
 
 
380 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 
370 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  65.5 
 
 
372 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  65.14 
 
 
372 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  60.48 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.79 
 
 
380 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.03 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.14 
 
 
367 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.9 
 
 
407 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.9 
 
 
407 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.23 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.18 
 
 
372 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.53 
 
 
383 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
387 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
387 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.8 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
390 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.82 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
376 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  33.65 
 
 
334 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.32 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
442 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
374 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.05 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
492 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  22.88 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
393 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
500 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 
394 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
393 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
496 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 
430 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  29.86 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
382 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
442 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
375 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
389 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
390 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  23.73 
 
 
447 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  28.18 
 
 
338 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 
430 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 
395 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.35 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
983 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.52 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  30.93 
 
 
460 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  25.59 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  20.07 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
447 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>