112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2633 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  97.58 
 
 		 372 aa  672    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  67.56 
 
 		 373 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  65.14 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  61.62 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 370 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  57.89 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  29.02 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.24 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.7 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.05 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.1 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.05 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.05 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  24.4 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.46 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.95 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 393 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.76 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  23.65 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  23.65 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  23.65 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  23.65 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  31.55 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 442 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.78 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  23.15 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  23.15 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.85 
 
 		 822 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 389 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  28.51 
 
 		 447 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  21.89 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.72 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  25.23 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 351 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 496 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 984 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0123  N-methyltryptophan oxidase  20.79 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.76 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>