131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3094 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  100 
 
 		 381 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  60 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  45.16 
 
 		 426 aa  315  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.6 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.87 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.23 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.23 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.23 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.01 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  27.47 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  31.5 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  28.03 
 
 		 552 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.94 
 
 		 657 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 660 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 660 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  46.67 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  39.56 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 708 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 711 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 711 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 711 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3248  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.38 
 
 		 648 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  33.76 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  33.76 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.41 
 
 		 708 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0004  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 643 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 643 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0085  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 643 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.48 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5235  D-amino-acid dehydrogenase  52.73 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5323  D-amino-acid dehydrogenase  52.73 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.161486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5615  D-amino-acid dehydrogenase  52.73 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133637  normal  0.925695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  50 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  23.5 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  23.04 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  35.29 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  33.12 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.28 
 
 		 657 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  24.12 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3596  FAD dependent oxidoreductase  54.17 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307288  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.41 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.07 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  48.15 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  24.79 
 
 		 699 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0056  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.48 
 
 		 652 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.48 
 
 		 652 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0198  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.777626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 965 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  31.06 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  26 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  26 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  28.85 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  30.05 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  52.08 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  30.34 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.91 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  38.67 
 
 		 665 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1977  hypothetical protein  41.27 
 
 		 697 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.91 
 
 		 644 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>