69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2990 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 377 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  40.11 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  40.66 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  40.66 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.7 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  39.12 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.78 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.8 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 371 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  30.95 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.24 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 447 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  30.88 
 
 		 447 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.59 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  49.02 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  29.22 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  44.58 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6672  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  52.17 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 377 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  41.18 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  28.98 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 385 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 424 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.09 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.09 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>