157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0054 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 371 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  72.51 
 
 		 371 aa  517  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  66.58 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  59.95 
 
 		 373 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  61.62 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  61.62 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.12 
 
 		 380 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.03 
 
 		 426 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.02 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.02 
 
 		 407 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  28.96 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.6 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.11 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  25.71 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.96 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.89 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.08 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  25.21 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  25.93 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 451 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  22.69 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.88 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 442 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  25.89 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 446 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  26.92 
 
 		 822 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 393 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  25.76 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 983 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 823 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 816 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  33.58 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.64 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  35.37 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  31.18 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>