105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1285 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 371 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6735  FAD dependent oxidoreductase  57.57 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2990  FAD dependent oxidoreductase  51.09 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5366  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4839  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.59 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0215652  hitchhiker  0.000104965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6219  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  37.77 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4472  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  38.96 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4606  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  38.96 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3094  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.33 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224046  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0101  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  32.98 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3401  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.76 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.067104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  34.07 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1318  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.580199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  33.51 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5636  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0161199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1302  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  31.12 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.490757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2008  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.281649  normal  0.0887503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2633  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0026  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2528  N-methyltryptophan oxidase  30.84 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.71 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 496 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1989  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00570868  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  29.41 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 500 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 500 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  22.41 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  33.06 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  28.24 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.39 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  44.07 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  40.7 
 
 		 400 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  43.64 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75910  squalene epoxidase(monooxygenase), erosterol biosynthesis  65.62 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0304  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  36.78 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  25.19 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2018  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0566522 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  44.07 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1962  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  34.57 
 
 		 245 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 837 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  51.11 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  35.71 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  46.51 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  35.44 
 
 		 500 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  38.37 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  38.37 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  46.67 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.08 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 		 494 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  35.8 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2449  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0412608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>