88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1418 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
450 aa  912    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  48.73 
 
 
500 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  49.36 
 
 
500 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  48.94 
 
 
500 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  44.78 
 
 
511 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  43.16 
 
 
511 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  40.17 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  36.93 
 
 
516 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  33.8 
 
 
494 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  34.57 
 
 
496 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  36.73 
 
 
524 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  33.27 
 
 
498 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  34.65 
 
 
512 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  33.98 
 
 
480 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  35.02 
 
 
520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  29.64 
 
 
549 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  29.18 
 
 
472 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  30.39 
 
 
538 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  28.08 
 
 
1033 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  29.22 
 
 
519 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  27.88 
 
 
537 aa  173  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  31.8 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
539 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  31.58 
 
 
463 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  31.58 
 
 
463 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  31.58 
 
 
463 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  28.87 
 
 
436 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  23.14 
 
 
465 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  23.68 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.49 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  24.1 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.64 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.76 
 
 
722 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  27.08 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.33 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.47 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.94 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.29 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  27.11 
 
 
538 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.67 
 
 
491 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  24.12 
 
 
452 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.88 
 
 
459 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  28.29 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.44 
 
 
459 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  21.86 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  54.55 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  24 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  23.51 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  33.13 
 
 
460 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  32.31 
 
 
1293 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  30.73 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  29.7 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  22.74 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  23.84 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  48.44 
 
 
434 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  45.59 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  22.52 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  27.56 
 
 
510 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  45.28 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  45 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.08 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  43.04 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  30.25 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 
551 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  31.37 
 
 
525 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  52.94 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  37.78 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
487 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  21.94 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
371 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 
482 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  50.85 
 
 
545 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  33.01 
 
 
465 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
531 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  50 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  43.64 
 
 
495 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  43.64 
 
 
495 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
568 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.56 
 
 
522 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  50 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  38.27 
 
 
436 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  38.27 
 
 
436 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  43.28 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>