146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0611 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  97.74 
 
 		 400 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  100 
 
 		 401 aa  806    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  100 
 
 		 401 aa  806    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  70.13 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  42.68 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  40.2 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  38.65 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  36.91 
 
 		 396 aa  282  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  37.22 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  38.71 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.55 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  23.68 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  25.54 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.74 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  27.96 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.26 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  53.57 
 
 		 484 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  24.79 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  24.29 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  27.62 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  48.21 
 
 		 245 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.22 
 
 		 495 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  22.67 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.46 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  21.44 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.42 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  25.22 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  41.1 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.36 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  22.02 
 
 		 476 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.15 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  48.21 
 
 		 476 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  23.94 
 
 		 476 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 545 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  38.14 
 
 		 544 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  22.2 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  26.62 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  23.49 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  45.83 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  39.06 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  38.33 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  43.64 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  44.07 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  41.79 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  20.56 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  23.4 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  46.55 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  41.38 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  50 
 
 		 492 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  44.64 
 
 		 468 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  26.73 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  58.54 
 
 		 487 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.37 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.64 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  48.28 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  35.38 
 
 		 599 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  37.5 
 
 		 556 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  27.3 
 
 		 488 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  20.34 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  20.34 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  20.34 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  36.51 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  51.28 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  31.2 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  44.64 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  20.22 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  47.27 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  39.29 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  41.18 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  30.4 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  37.31 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  42.59 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  30.4 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  31.09 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.81 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  42.59 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  30.4 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  53.85 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  46.3 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  32.31 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  35.38 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  42.86 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>