211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0027 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 463 aa  950    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  42.03 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  39.69 
 
 		 469 aa  309  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  40.27 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  40.27 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  39.68 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  37.09 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  34.6 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  34.88 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  34.59 
 
 		 475 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  34.25 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  35.85 
 
 		 469 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  35.17 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  34.43 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  34.91 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  33.41 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  32.42 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  31.53 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  32.49 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  32.45 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 		 491 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  31.69 
 
 		 476 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  32.33 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  27.93 
 
 		 479 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  25.95 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  30.9 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  28.34 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 		 456 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.43 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  30.07 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 		 460 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.62 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.62 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.62 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 466 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  25.47 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  30.52 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  27.14 
 
 		 471 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  27.79 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.45 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  29.57 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  27.64 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  27.92 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.98 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  26.01 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  26.55 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  28.84 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 		 482 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.57 
 
 		 589 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  22.51 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  24.13 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  22.84 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  23.35 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  22.05 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  21.4 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  30.04 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  23.4 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  23.4 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  21.12 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  24.68 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>