103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0121 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 424 aa  868    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.3 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  24.24 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.49 
 
 		 469 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 470 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  24.61 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  21.74 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.84 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.83 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  22.62 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.75 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.17 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.45 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.91 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  21.61 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  21.61 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  22.87 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  20.89 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  21.75 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  25.3 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  19.28 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  19.55 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  23.95 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  19.55 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  19.55 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  23.48 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  23.48 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  21.1 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  19.28 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  19.43 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  24.34 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  20.33 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  19.49 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  19.14 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  22.84 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  19.04 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  22.82 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  20.67 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  24.16 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  19.91 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  21.17 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  28 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  25.32 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  25.4 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  20.52 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  21.21 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  21.97 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  20.13 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.64 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  38.96 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  21.13 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  23.91 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  23.66 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  19.44 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  34.94 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.89 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  20.35 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.89 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.89 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 346 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  20.7 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  20.43 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  42.59 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  36.84 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  42.59 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  20.24 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  29.75 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  36.54 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  42.59 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  37.97 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  37.5 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  40.74 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  40.74 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  32.61 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  42.59 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  35.59 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  30.12 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  23.51 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  41.94 
 
 		 549 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>