86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55152 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 553 aa  1117    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  27.76 
 
 		 589 aa  150  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03920  protoporphyrinogen oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08440)  26.73 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.556614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  25.41 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 469 aa  104  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  25.43 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.26 
 
 		 467 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.99 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.99 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  31.14 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.85 
 
 		 469 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 		 467 aa  91.3  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.72 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  23.44 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  23.75 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  21.65 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  23.48 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  22.3 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  24.19 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  30.24 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  31.44 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  25.66 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  25.66 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.27 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.88 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  22.53 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  23.88 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.4 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  22.53 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  23.47 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  25.07 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.45 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  22.83 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.45 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  28.44 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  25.15 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.69 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  27.4 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  19.68 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 		 488 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  25.85 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  20.8 
 
 		 470 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  27.14 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 474 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  44.23 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.27 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  38.98 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  21.23 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 		 473 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 462 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  25.69 
 
 		 470 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.78 
 
 		 1432 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  55.26 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  41.67 
 
 		 458 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 419 aa  44.3  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3035  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 356 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  26.29 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.78 
 
 		 1428 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  26.15 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  41.27 
 
 		 428 aa  43.9  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.83 
 
 		 1425 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.73 
 
 		 421 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>