More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1200 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 473 aa  990    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0530  glutamate synthase, small subunit  43.04 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0212146  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1175  glutamate synthase subunit beta  41.38 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1486  glutamate synthase, small subunit  42.52 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  40.38 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 667 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1483  glutamate synthase, small subunit  42.37 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  41.97 
 
 		 485 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.5 
 
 		 674 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  39.66 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  41.51 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  41.29 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  41.51 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.87 
 
 		 671 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  41.29 
 
 		 468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  41.65 
 
 		 472 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  40.59 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.83 
 
 		 671 aa  339  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  39.03 
 
 		 472 aa  339  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  39.03 
 
 		 472 aa  339  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  41.65 
 
 		 468 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  40.59 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  40.21 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  40.26 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  41.11 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  41.11 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  40.21 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  41.87 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  39.53 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  40.59 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  40.59 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  39.96 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  39.96 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  40.59 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  40.59 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  40.59 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.96 
 
 		 659 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.62 
 
 		 671 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  41 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.45 
 
 		 652 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  40.59 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  39.96 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.08 
 
 		 674 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  38.82 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  38.05 
 
 		 469 aa  336  7e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  39.78 
 
 		 468 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  40.51 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  39.96 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  40.47 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  39.75 
 
 		 472 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  39.75 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  41.01 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  39.75 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  40.35 
 
 		 469 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  41.36 
 
 		 473 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  39.75 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01630  glutamate synthase subunit beta  40.04 
 
 		 471 aa  332  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  39.96 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  39.96 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  39.75 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 		 468 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  41.23 
 
 		 472 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  38.95 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  41.01 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2164  glutamate synthase subunit beta  39.87 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0515227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  40.47 
 
 		 473 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 		 472 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  39.45 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  39.92 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.39 
 
 		 658 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  38.76 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  38.49 
 
 		 469 aa  319  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.38 
 
 		 653 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  38.19 
 
 		 469 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.17 
 
 		 653 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  38.46 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.17 
 
 		 653 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.17 
 
 		 653 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03318  glutamate synthase subunit beta  37.4 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.92 
 
 		 653 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  39.66 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1955  glutamate synthase subunit beta  40.04 
 
 		 471 aa  315  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004469  glutamate synthase [NADPH] small chain  40.34 
 
 		 470 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2165  glutamate synthase subunit beta  36.44 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  36.7 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2768  glutamate synthase subunit beta  38.25 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.407102  normal  0.66325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>