203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1794 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
419 aa  840    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  44.31 
 
 
423 aa  335  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  29.89 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.51 
 
 
471 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  29.49 
 
 
442 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 
469 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 
482 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  28.18 
 
 
441 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  32.17 
 
 
475 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  27.84 
 
 
495 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  26.49 
 
 
469 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  28.48 
 
 
463 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 
491 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  27.83 
 
 
469 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  30.41 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  27.02 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  30.77 
 
 
459 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  25.19 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 
465 aa  90.5  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  24.93 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  28.18 
 
 
446 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  28.18 
 
 
446 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.3 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
466 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.62 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  25.11 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  30.91 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  26.48 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  27.45 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  27.71 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  24.17 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.47 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  27.71 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 
466 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  27.3 
 
 
520 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  28.75 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  23.26 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  23.87 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.56 
 
 
466 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.07 
 
 
466 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 
473 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.43 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  26.71 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
473 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  24.21 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  22.82 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  25.75 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  25.36 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  23.98 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.41 
 
 
473 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  23.05 
 
 
473 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  28.8 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  26.03 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  25.71 
 
 
415 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  23.08 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 
482 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  24.4 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 
473 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 
471 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  26.08 
 
 
470 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  25.83 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  23.17 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  27.6 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  26.12 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  23.06 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.39 
 
 
460 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 
469 aa  56.6  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  23.81 
 
 
456 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  24.38 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  25.24 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  40.62 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  21.03 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  26.58 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  30.46 
 
 
451 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  25.24 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  23.85 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  24 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  28.42 
 
 
425 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  26.29 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 
488 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>