148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0521 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 467 aa  942    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  61.19 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  62.82 
 
 		 495 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  62.96 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  61.32 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  52.26 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  33.26 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  37.17 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  33.06 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 473 aa  256  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  34.59 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  32.29 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  32.22 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  33.91 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  31.66 
 
 		 473 aa  249  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  34.39 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.24 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  33.13 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  31.79 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  35.29 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  34.72 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  32.11 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  38.33 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  38.33 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  36.43 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  30.89 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  34.7 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  29.85 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  32.14 
 
 		 491 aa  210  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  31.06 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  32.46 
 
 		 454 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  29.85 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 		 466 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  27.88 
 
 		 466 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  32.24 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.65 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  33.05 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.29 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  26.93 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  29.16 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  26.99 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  26.78 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  27.2 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  27.62 
 
 		 466 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.15 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  26.25 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  26.25 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  26.25 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  26.04 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  30.57 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  32.51 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  27.71 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.35 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  27.25 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  28.73 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  28.33 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  29.62 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  26.87 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  26.56 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  27.31 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  29.89 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  28.89 
 
 		 493 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  30.37 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.54 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  27.16 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.48 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  26.08 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.39 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  26.48 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.48 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 		 553 aa  93.6  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  28.27 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.78 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  27.78 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  23.71 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  25.66 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  24.36 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  25.47 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03920  protoporphyrinogen oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08440)  25.38 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.556614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.71 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  26.85 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  22.68 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>