163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0933 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  100 
 
 		 400 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  62.03 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  61.89 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  49.75 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  46.8 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  46.72 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  47.7 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  44.05 
 
 		 412 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  45.76 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  40.36 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  40.9 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  40.2 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  40.2 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  23.28 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  23.13 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  23.71 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.01 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  23.74 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  22.94 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  25.85 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  22.46 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  24.06 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.82 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  24.07 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  28.19 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.25 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  21.62 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  31.39 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  23.99 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.62 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  21.93 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  31.97 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  26.11 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  49.15 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  49.15 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  23.04 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  33.75 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  33.75 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.15 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  35 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  33.75 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.38 
 
 		 472 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  36.84 
 
 		 474 aa  53.5  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  23.55 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  23.29 
 
 		 482 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  35 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  23.03 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  35.53 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  36.84 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.5 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  36.84 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 		 490 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.99 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  32.38 
 
 		 472 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  24.08 
 
 		 470 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  23.22 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  23.42 
 
 		 472 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 		 465 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  45.65 
 
 		 923 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  21.21 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  20.17 
 
 		 469 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  23.37 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 466 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  23.36 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  39.47 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 722 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  31.65 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  34.67 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 589 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  23.77 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.1 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  29.93 
 
 		 500 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  27.71 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  27.56 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  36.76 
 
 		 628 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  40.54 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  21.03 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  31.39 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  43.1 
 
 		 484 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  24.77 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  25 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  26.05 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.77 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  21.37 
 
 		 436 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  21.84 
 
 		 372 aa  46.2  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.45 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  22.02 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>