147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54800 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  100 
 
 		 923 aa  1927    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 547 aa  268  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  27.18 
 
 		 535 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.87 
 
 		 544 aa  227  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.69 
 
 		 522 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.45 
 
 		 511 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.42 
 
 		 511 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  26.69 
 
 		 530 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.81 
 
 		 503 aa  94.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.06 
 
 		 520 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.88 
 
 		 509 aa  90.9  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.14 
 
 		 509 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  22.68 
 
 		 509 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.39 
 
 		 509 aa  88.6  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  22.05 
 
 		 502 aa  88.6  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.25 
 
 		 547 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  22.38 
 
 		 508 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.31 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.77 
 
 		 499 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.31 
 
 		 512 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  22.93 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  21.44 
 
 		 505 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.79 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  23.46 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  23.85 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  19.69 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  22.87 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.55 
 
 		 740 aa  77.8  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 506 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.9 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  23.48 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  19.16 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.17 
 
 		 501 aa  72  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.92 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.43 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.38 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  22.52 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 512 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  22.24 
 
 		 527 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  20.28 
 
 		 510 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  21.54 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  23.11 
 
 		 504 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  25.4 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  21.09 
 
 		 520 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  21.55 
 
 		 554 aa  64.3  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.13 
 
 		 554 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  26.1 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  24.72 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  18.28 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  22.07 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.42 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 512 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  20.43 
 
 		 563 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  25.57 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  22.88 
 
 		 520 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  24.39 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  24.62 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  22.74 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  22.92 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  48.08 
 
 		 938 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  20.88 
 
 		 492 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 561 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  23.39 
 
 		 508 aa  56.2  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25 
 
 		 556 aa  54.7  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  20.95 
 
 		 518 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  21.7 
 
 		 516 aa  54.7  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 545 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.02 
 
 		 503 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  37.21 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  21.6 
 
 		 506 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  48.33 
 
 		 502 aa  53.9  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  48.44 
 
 		 504 aa  53.5  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  25.12 
 
 		 495 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 552 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  20.5 
 
 		 519 aa  52.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42980  predicted protein  19.71 
 
 		 950 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  20.88 
 
 		 488 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  26.96 
 
 		 505 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  23.67 
 
 		 505 aa  52  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  39.29 
 
 		 484 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.13 
 
 		 370 aa  50.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  45.28 
 
 		 571 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 532 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  23.71 
 
 		 517 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  35.19 
 
 		 501 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 		 536 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  40 
 
 		 359 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  45.65 
 
 		 400 aa  48.9  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 496 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>