288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2262 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  89.22 
 
 
436 aa  816    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  86.93 
 
 
436 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  86.93 
 
 
436 aa  791    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  85.32 
 
 
436 aa  780    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  86.24 
 
 
436 aa  791    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  86.93 
 
 
436 aa  796    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  88.99 
 
 
436 aa  811    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  86.47 
 
 
436 aa  787    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  100 
 
 
436 aa  900    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  34.6 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1523  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 
402 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  34.82 
 
 
465 aa  64.3  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  22.39 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  36.36 
 
 
499 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  21.45 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  44.07 
 
 
245 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  44.07 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  40.79 
 
 
505 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.36 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  21.41 
 
 
501 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  24.11 
 
 
507 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  41.18 
 
 
519 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  32.81 
 
 
420 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  24.43 
 
 
433 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  24.38 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  21.67 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  30.89 
 
 
463 aa  54.3  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
469 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  22.09 
 
 
493 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 
530 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 
399 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  37.14 
 
 
460 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  24.11 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  55 
 
 
529 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.48 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  23.08 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  31.67 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.77 
 
 
479 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  22.16 
 
 
506 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  33.08 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  40.28 
 
 
500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  40.68 
 
 
525 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  63.16 
 
 
505 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  42 
 
 
488 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  40.68 
 
 
476 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  29.75 
 
 
485 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1076  UDP-galactopyranose mutase  30.63 
 
 
370 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  26.04 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  36.36 
 
 
500 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  41.38 
 
 
437 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  21.32 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  36.25 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  32.18 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  36.59 
 
 
507 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  23.7 
 
 
523 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  41.18 
 
 
503 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
469 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  38.89 
 
 
500 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  21.07 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  36.25 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  40.74 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  40.74 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  34.48 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  48.08 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  24.78 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  34.48 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
722 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  35.11 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  35.8 
 
 
504 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  30.25 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  20.18 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  21.79 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  40 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  52.27 
 
 
547 aa  48.5  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  40.98 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  31.76 
 
 
499 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  35.43 
 
 
474 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  31.31 
 
 
938 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  43.64 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  41.51 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 
482 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  21.18 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  36.51 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
488 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.89 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  36.51 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  39.71 
 
 
370 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.89 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  36.51 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  26.36 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  61.11 
 
 
504 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  40 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  32.65 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>