217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2728 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 		 427 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  38.52 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  29.84 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  31.49 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.54 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  30.2 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  33.71 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.34 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.91 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  32.29 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.03 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  31.38 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.22 
 
 		 495 aa  86.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.09 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.47 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.73 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.32 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.26 
 
 		 628 aa  77  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  27.46 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.44 
 
 		 1199 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.16 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  28.73 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.79 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.42 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.64 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  23.25 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.76 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  29.05 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.86 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.74 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  26.98 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  58.18 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.71 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  27.08 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  36.67 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.56 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  27.6 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  26.02 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  26.07 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.86 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  26.38 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.84 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  27.58 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.24 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  26.05 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  24.45 
 
 		 1274 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  45.16 
 
 		 657 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.57 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  20.84 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  39.32 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.41 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.81 
 
 		 523 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  44.29 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  41.56 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  60.98 
 
 		 557 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.9 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  52.73 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  52.73 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  40.26 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 487 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.07 
 
 		 511 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 487 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 490 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  25.63 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  25.61 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  43.59 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.2 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  69.44 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  25.12 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  37.37 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  40.26 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  20.48 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.17 
 
 		 592 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  20.48 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  24.89 
 
 		 999 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  24.4 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  20.48 
 
 		 478 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.77 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  40.28 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  69.44 
 
 		 463 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  25.39 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  23.44 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  35.66 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  29.05 
 
 		 503 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.4 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  22.32 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  30.77 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  60.47 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  37.97 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>