289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2620 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  100 
 
 		 451 aa  891    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  36.53 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  38.89 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  37.95 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  31.39 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  28.88 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  31.99 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  33.71 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  33.49 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.91 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.58 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.54 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.92 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  31.78 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.67 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.69 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.6 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.9 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.6 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  32.35 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.15 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  32.08 
 
 		 1199 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.88 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.94 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.37 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.12 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.12 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  27.03 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.55 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  27.1 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.12 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  28.84 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  27.98 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  26.97 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  27.46 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  29.75 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  31.71 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  28.44 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.36 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.9 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  21.21 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  27.92 
 
 		 1274 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  22.2 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  21.04 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  23.78 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  26.42 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.71 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.7 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.21 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  21.31 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.97 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  20.83 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.57 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.4 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  20.91 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  28.71 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  26.86 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.5 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  25.24 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.82 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  27.4 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  26.5 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  25.52 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.27 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  23.32 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  28.13 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.19 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  28.18 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  28.05 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.16 
 
 		 628 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.88 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  21.25 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.11 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  27.83 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  28.74 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  28.18 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  28.25 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.29 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  20.87 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  26.55 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.09 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  26.83 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  27.38 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.1 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  27.88 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  20.25 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.57 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.35 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.45 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  27.32 
 
 		 999 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.36 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.09 
 
 		 616 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.97 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.19 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>