205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0744 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  100 
 
 
420 aa  839    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  56.71 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  50.96 
 
 
419 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  51.84 
 
 
414 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  51.22 
 
 
422 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  49.87 
 
 
422 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  49.87 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  50.26 
 
 
415 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  50.77 
 
 
413 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  49.64 
 
 
422 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  48.9 
 
 
423 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  42.97 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  44.58 
 
 
412 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  38.37 
 
 
430 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  38.81 
 
 
463 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  38.77 
 
 
420 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  37.91 
 
 
429 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  38.78 
 
 
425 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  37.03 
 
 
424 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  37.99 
 
 
419 aa  210  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  35.52 
 
 
442 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.66 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  35.07 
 
 
442 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  34.61 
 
 
450 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.7 
 
 
495 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  27.8 
 
 
436 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.04 
 
 
495 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  32.08 
 
 
435 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  33.49 
 
 
427 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  35.6 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.75 
 
 
466 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.82 
 
 
445 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  32.34 
 
 
479 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  35.11 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  30.38 
 
 
476 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  29.08 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.68 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 
474 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  31.01 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.48 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  29.47 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  30.85 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  30.48 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  28.47 
 
 
470 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.85 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  28.51 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.04 
 
 
481 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.21 
 
 
463 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 
476 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.66 
 
 
413 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  26.88 
 
 
450 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 
504 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  25.97 
 
 
1199 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  29.53 
 
 
429 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.36 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.1 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  25.34 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.33 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.83 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.51 
 
 
536 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  25.47 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.59 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  27.9 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.05 
 
 
1274 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.51 
 
 
484 aa  73.6  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.5 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  26.58 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  30.93 
 
 
999 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.4 
 
 
480 aa  63.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.81 
 
 
435 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  27.08 
 
 
577 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  27.14 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.76 
 
 
657 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.89 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  30.12 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  43.55 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  45.61 
 
 
462 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.43 
 
 
496 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  26.81 
 
 
543 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  25.48 
 
 
469 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  24.02 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  45.45 
 
 
463 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  42.19 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  36.76 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  34.17 
 
 
501 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  25 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  38.27 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  44.07 
 
 
450 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  44.07 
 
 
450 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  47.69 
 
 
353 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  43.86 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  46.97 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  41.43 
 
 
361 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  26.25 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.74 
 
 
496 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  50 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  27.16 
 
 
510 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  22.42 
 
 
477 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>