174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0413 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  100 
 
 		 422 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  84.18 
 
 		 422 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  82.24 
 
 		 414 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  70.1 
 
 		 419 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  68.43 
 
 		 456 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  63.24 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  64.43 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  53.52 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  51.22 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  46.6 
 
 		 422 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  46.48 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  43.3 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  44.36 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  41.62 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  41.88 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  40.36 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  40.46 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  40.1 
 
 		 425 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  37.53 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  36.75 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 474 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 		 476 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  32.12 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  34.52 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.59 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  31.89 
 
 		 485 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  30.14 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  33.81 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 504 aa  142  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  29.91 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  27.78 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.6 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  34.02 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.47 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.85 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  34.86 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  36.67 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.65 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  32.37 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.9 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.23 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  34.37 
 
 		 476 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  29.37 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  30.24 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  31.32 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.67 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  29.91 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  28.03 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.18 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  31.75 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.94 
 
 		 445 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.19 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.12 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.7 
 
 		 468 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.03 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  24.33 
 
 		 463 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.09 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.12 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.78 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.09 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  24.09 
 
 		 1199 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  26.56 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.74 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.2 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.59 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.56 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  28.65 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  29.46 
 
 		 1274 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  24.6 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  33.33 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.79 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  26.34 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.86 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  25.86 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  28.22 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  21.15 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  35.96 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  25.78 
 
 		 999 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  25.49 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  40.24 
 
 		 543 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.51 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  42.67 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.37 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.14 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.14 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  25.11 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  42.65 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  47.54 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  19.8 
 
 		 494 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  43.42 
 
 		 493 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  58.54 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  40.48 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  45.76 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  50 
 
 		 537 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>