185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4843 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  84.11 
 
 		 430 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  100 
 
 		 420 aa  831    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  80.62 
 
 		 429 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  96.43 
 
 		 463 aa  773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  77.99 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  56.3 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  48.33 
 
 		 409 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  41.87 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  41.62 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  42.82 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  40.46 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  41.94 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  41.41 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  42.26 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  39.65 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  41.16 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  40.65 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  39.14 
 
 		 420 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  37.63 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.14 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.63 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.85 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  29.75 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  33.75 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 474 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.86 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  34.34 
 
 		 438 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.25 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  32.67 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  32.18 
 
 		 480 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  30.05 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  34.83 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.74 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.11 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  29.41 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.5 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.17 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.6 
 
 		 434 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  31.39 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  27.93 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.84 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  31.73 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  27.78 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.75 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  25.46 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  29.09 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.68 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.79 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.3 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  26.75 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  45.59 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  27.33 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  54.55 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  30.52 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.21 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.12 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.31 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.79 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  49.18 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.54 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  50.91 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  41.1 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  25 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  30.27 
 
 		 1199 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  50.85 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  45.45 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.82 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  40.7 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  42.86 
 
 		 537 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.33 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  49.15 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  47.54 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  49.15 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  47.54 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  47.54 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  45.9 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  33.33 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  38.96 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  45.45 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  38.96 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  53.45 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  46.43 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  39.68 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  45.31 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  44.26 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  44.26 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  30.19 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  41.1 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  43.64 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  47.46 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  37.14 
 
 		 657 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  43.1 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  26.16 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  49.18 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  37.33 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.15 
 
 		 1274 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.38 
 
 		 619 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>