149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1384 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  80.62 
 
 
420 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  100 
 
 
429 aa  835    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  82.74 
 
 
424 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  85.31 
 
 
430 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  80.34 
 
 
463 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  54.85 
 
 
412 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  46.02 
 
 
409 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  42.89 
 
 
419 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  40.46 
 
 
422 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  39.9 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  40.58 
 
 
423 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  40.05 
 
 
456 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  40.11 
 
 
422 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  39.65 
 
 
414 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  40.7 
 
 
415 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  39.59 
 
 
413 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  38.81 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  39.4 
 
 
422 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  37.64 
 
 
425 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.87 
 
 
419 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.19 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.42 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  30.81 
 
 
463 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  32.48 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  30.19 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.5 
 
 
417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.83 
 
 
474 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  31.21 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  31.15 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
476 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.7 
 
 
442 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  29.26 
 
 
450 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.46 
 
 
442 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  27.36 
 
 
436 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  33.69 
 
 
438 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.14 
 
 
479 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  28.44 
 
 
450 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 
504 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  32.33 
 
 
458 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.75 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  34.09 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.82 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 
476 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.66 
 
 
427 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  29.08 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  27.25 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.27 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.81 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.62 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.28 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.83 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.62 
 
 
536 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.52 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  42.65 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
470 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.72 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.05 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.37 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.08 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.54 
 
 
451 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.87 
 
 
1199 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  49.09 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.12 
 
 
411 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  40.43 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  47.27 
 
 
457 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  49.15 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  41.82 
 
 
463 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  30.66 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 
342 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  42.86 
 
 
537 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 
342 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  44.83 
 
 
450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  44.83 
 
 
450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  43.75 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  37.14 
 
 
657 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  45.45 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.34 
 
 
498 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.83 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.34 
 
 
498 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  42.62 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  42.62 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  43.1 
 
 
519 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  44.07 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  44.07 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  40 
 
 
496 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.77 
 
 
407 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  49.18 
 
 
490 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  41.82 
 
 
462 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  40.68 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  37.5 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  34.09 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  41.82 
 
 
463 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  46.43 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  40.68 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.1 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.21 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  30.37 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>