72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30946 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  100 
 
 
484 aa  991    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.24 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.08 
 
 
495 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  24.94 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  22.77 
 
 
495 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.45 
 
 
479 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  25.34 
 
 
463 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  23.82 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  24.09 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  23 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  25 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.24 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  25.52 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.1 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  24.05 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  21.61 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  24.83 
 
 
463 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  25.12 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  24.71 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  25.34 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  23.19 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  24.89 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  24.59 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  23.58 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  21.83 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  25.9 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  26.03 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  28.35 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  24.54 
 
 
1274 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  25.85 
 
 
446 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  23.65 
 
 
413 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  22.89 
 
 
418 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25.41 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  22.02 
 
 
422 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  23.79 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  25.1 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  23.29 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  23.14 
 
 
414 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  24.88 
 
 
430 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  24.11 
 
 
429 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  23.24 
 
 
422 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  28.16 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  23.25 
 
 
451 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  20.77 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.6 
 
 
536 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  22.82 
 
 
999 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  27.36 
 
 
412 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  23.47 
 
 
408 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  20.99 
 
 
468 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  20.15 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  26.02 
 
 
1199 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  25.7 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  24.02 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  25 
 
 
436 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.41 
 
 
628 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  25.52 
 
 
525 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  26.09 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  23.02 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  23.29 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  23.9 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  26.32 
 
 
577 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.89 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  23.53 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  24.42 
 
 
450 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  24.14 
 
 
512 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  22.31 
 
 
459 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  21.11 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  22.57 
 
 
435 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.65 
 
 
572 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>