114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1419 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  100 
 
 		 419 aa  816    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  41.99 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  37.74 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  38.93 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  36.74 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  36.32 
 
 		 422 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  35.58 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  36.48 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  37.56 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  36.41 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  38.19 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  35.66 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  37.37 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  36.66 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  38.68 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  35.66 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  36.12 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  37.73 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  36.25 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  38.13 
 
 		 476 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  36.34 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  34.67 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  34.91 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.03 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  37.56 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.02 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  33.59 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  34.26 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  29.93 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  32.5 
 
 		 442 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  35.08 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.64 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  32.75 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  37.08 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.29 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  31.34 
 
 		 450 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.24 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.73 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  29.05 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.83 
 
 		 495 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  31.52 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  30.84 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.17 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  32.11 
 
 		 457 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.7 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.64 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  33.33 
 
 		 434 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  25.78 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  27.1 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.94 
 
 		 1199 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.25 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.07 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.05 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.4 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  32.85 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.72 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  26.98 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  26.49 
 
 		 999 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.11 
 
 		 1274 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  50.88 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.17 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  30.48 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.09 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.16 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  42.86 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  24.52 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  38.67 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.06 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  28 
 
 		 487 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  43.1 
 
 		 532 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  24.34 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  34.09 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  38.1 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.53 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  21.26 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  21.3 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  35.82 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  44.44 
 
 		 456 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.17 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  25.97 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.67 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.16 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.16 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  25.16 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  47.46 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.09 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  47.46 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  43.1 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  41.67 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  44.07 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  50 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24 
 
 		 625 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.76 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.59 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  35.56 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>