More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3468 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  100 
 
 		 436 aa  860    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  33.03 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  37.87 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  36.12 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  29.49 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  29.83 
 
 		 422 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  30.69 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  32.36 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.03 
 
 		 495 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.37 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  30.55 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.56 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.61 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  32.3 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  30.16 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  29.93 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.23 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.21 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  29.56 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.34 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  30.5 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  28.93 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.94 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  27.05 
 
 		 468 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  28.31 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  29.26 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.54 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  29.22 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  28.44 
 
 		 420 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.82 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  29.05 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  27.55 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  30.38 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  24.88 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  29.89 
 
 		 1199 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.71 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  27.95 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.63 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  28.05 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  25.96 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.84 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  27.02 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.9 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.89 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  28.7 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  28.27 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.31 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  27.45 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.45 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  27.45 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.21 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.19 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.84 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  28.04 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.62 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.64 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  31.21 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  29.59 
 
 		 1274 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  21.79 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  28.94 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  21.79 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  24.24 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  30.53 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  26.56 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  26.3 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  29.89 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  24.71 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  27.87 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.27 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  28.4 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.54 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.07 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.38 
 
 		 565 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  21.07 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.27 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  23.79 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  28.36 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  25.78 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.75 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.14 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  27.04 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  27.29 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.45 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  26.53 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  50.75 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  50.75 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  27.06 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  53.45 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.18 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  40 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  50.77 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  24.42 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>