87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44106 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  100 
 
 		 577 aa  1206    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  26.26 
 
 		 1199 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.05 
 
 		 435 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.57 
 
 		 495 aa  123  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.81 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  25.6 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.06 
 
 		 427 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.95 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.44 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.52 
 
 		 436 aa  98.2  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.07 
 
 		 481 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  33.01 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  22.84 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  26.59 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  24.85 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  32.56 
 
 		 999 aa  80.5  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.52 
 
 		 1274 aa  80.1  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  27.27 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.43 
 
 		 536 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.57 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.37 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.08 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  28.81 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.07 
 
 		 433 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  23.37 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  26.2 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  25.14 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  24.32 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  27.53 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  40.45 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  27.42 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  27.42 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  23.31 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.03 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.08 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.6 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  22.53 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  25.21 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  23.25 
 
 		 600 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  28.68 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.27 
 
 		 487 aa  51.6  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.65 
 
 		 496 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  25.96 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  34.52 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  24.89 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  25.11 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.3 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  26.32 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  22.87 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  23.75 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.22 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  22 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  22.99 
 
 		 446 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.14 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  22.61 
 
 		 352 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  22.82 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  25.63 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  22.76 
 
 		 592 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  26.32 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  20.87 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  23.98 
 
 		 427 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  25.45 
 
 		 458 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  25.63 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  20.96 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  21.97 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  21.36 
 
 		 625 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  22.55 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  25.1 
 
 		 463 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  24.76 
 
 		 474 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  21.95 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  26.25 
 
 		 424 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  22.73 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  52.27 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  53.49 
 
 		 463 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10167  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 766 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.579474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  21.19 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  31.82 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  31.82 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.59 
 
 		 469 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.53 
 
 		 578 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  30.77 
 
 		 577 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  23.95 
 
 		 420 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  35.87 
 
 		 492 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 		 492 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>