126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51708 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  100 
 
 
418 aa  864    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  32.56 
 
 
479 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  36.28 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  34.55 
 
 
435 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  32.28 
 
 
628 aa  192  9e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  31.99 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  30.52 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  30.77 
 
 
1199 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  30.12 
 
 
470 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.67 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  29.36 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  30.4 
 
 
481 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.21 
 
 
427 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  29.4 
 
 
468 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  32.25 
 
 
1274 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  30.54 
 
 
463 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.96 
 
 
436 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  31.84 
 
 
999 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  26.07 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.23 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  26.65 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  89.7  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  26.59 
 
 
415 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  25.69 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.34 
 
 
536 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  25.58 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.46 
 
 
657 aa  83.2  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.41 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  26.27 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  26.35 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  25 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  28.04 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  26.84 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  25.94 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  26.11 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  24.06 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  24.11 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  26.57 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  24.69 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  25.46 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  25.23 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.19 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  24.45 
 
 
600 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  26.14 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  24.5 
 
 
484 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  24.23 
 
 
456 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  23.11 
 
 
474 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  25.47 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  24.49 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  22.8 
 
 
484 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  23.86 
 
 
485 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  27.24 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  23.01 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.03 
 
 
469 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  22.58 
 
 
459 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.43 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  25.88 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  22.62 
 
 
487 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  22.08 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.72 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  28.35 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  27.19 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  24.65 
 
 
422 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  26.4 
 
 
462 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.22 
 
 
496 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  24.41 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  23.37 
 
 
498 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  23.37 
 
 
498 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  22.64 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  23.55 
 
 
450 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  23.67 
 
 
434 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 
493 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.11 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  22.73 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  23.89 
 
 
446 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.83 
 
 
492 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  20.55 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  23.73 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  20.99 
 
 
528 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.75 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 
578 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.59 
 
 
525 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  25.26 
 
 
352 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  22.93 
 
 
459 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.86 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.32 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.2 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  21.99 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  25 
 
 
463 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  24.67 
 
 
494 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  21.54 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  43.06 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  21.54 
 
 
478 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.54 
 
 
478 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  22.76 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  22 
 
 
493 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.45 
 
 
469 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>