57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48603 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  100 
 
 
600 aa  1249    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.93 
 
 
479 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.65 
 
 
494 aa  94  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.42 
 
 
445 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  26.1 
 
 
445 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  22.47 
 
 
495 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  27.84 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.58 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  25.37 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.67 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  30.8 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.27 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  24.44 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.26 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.5 
 
 
1274 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.42 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  25.1 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  23.73 
 
 
433 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
470 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  24.48 
 
 
442 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.62 
 
 
422 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  29.28 
 
 
1199 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  24.22 
 
 
442 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  22.76 
 
 
470 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  27.2 
 
 
484 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  23.01 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  25.64 
 
 
458 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.45 
 
 
536 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.09 
 
 
445 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.36 
 
 
496 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.93 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25.1 
 
 
422 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  23.25 
 
 
577 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  23.08 
 
 
436 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  23.01 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.58 
 
 
496 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  24.15 
 
 
476 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  26.06 
 
 
480 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  26.86 
 
 
418 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  26.07 
 
 
425 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.39 
 
 
592 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  23.62 
 
 
427 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  20.93 
 
 
496 aa  47.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  28.57 
 
 
999 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  26.27 
 
 
419 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.03 
 
 
459 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  24.89 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  28.81 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  25.46 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.9 
 
 
625 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.29 
 
 
624 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  33.73 
 
 
457 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  24.65 
 
 
491 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  23.14 
 
 
413 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  25.91 
 
 
485 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  42.19 
 
 
469 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  24.91 
 
 
422 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>