244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42289 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  100 
 
 
628 aa  1302    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  37.24 
 
 
1274 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.76 
 
 
1199 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.48 
 
 
435 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  32.28 
 
 
418 aa  191  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  32.46 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  30.02 
 
 
445 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.52 
 
 
479 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.6 
 
 
427 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  31.61 
 
 
481 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  29.21 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.35 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.9 
 
 
495 aa  160  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.6 
 
 
468 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.58 
 
 
466 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  30.91 
 
 
463 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.98 
 
 
436 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.79 
 
 
536 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  33.48 
 
 
999 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.59 
 
 
494 aa  102  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.93 
 
 
496 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.03 
 
 
592 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
470 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.93 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.95 
 
 
565 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.64 
 
 
616 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.49 
 
 
625 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.62 
 
 
624 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.34 
 
 
478 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.34 
 
 
478 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.76 
 
 
619 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.49 
 
 
619 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  30.04 
 
 
491 aa  91.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.54 
 
 
491 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.18 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  24.89 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  24.85 
 
 
577 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.55 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.22 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  25.16 
 
 
657 aa  77  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.28 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  26.02 
 
 
429 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.94 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  20.49 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.11 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  24.34 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  22.03 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  20.73 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  24.29 
 
 
485 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  20.08 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25.62 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  28.27 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.03 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  22.52 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.02 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  26.55 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  22.53 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  25.88 
 
 
442 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  23.13 
 
 
450 aa  67  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.13 
 
 
478 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  27.92 
 
 
446 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  21.99 
 
 
487 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  22.59 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  21.41 
 
 
492 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.24 
 
 
449 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.13 
 
 
528 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  24.55 
 
 
420 aa  65.1  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.63 
 
 
478 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.37 
 
 
523 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.39 
 
 
525 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  24.25 
 
 
426 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.95 
 
 
459 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  25.46 
 
 
419 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  25.91 
 
 
600 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  28.57 
 
 
425 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.5 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  23.09 
 
 
533 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.81 
 
 
413 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  25.54 
 
 
427 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.65 
 
 
469 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  22.72 
 
 
524 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  26.64 
 
 
414 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  26.17 
 
 
415 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  23.26 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.15 
 
 
478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.15 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.15 
 
 
478 aa  58.9  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.38 
 
 
418 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.48 
 
 
456 aa  58.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  21.66 
 
 
530 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 
504 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  23.04 
 
 
576 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.45 
 
 
478 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  23.48 
 
 
448 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  24.94 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  24.5 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>