195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  69.96 
 
 
619 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  70.18 
 
 
616 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  67.94 
 
 
592 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  66.26 
 
 
565 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  100 
 
 
491 aa  973    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  64.83 
 
 
496 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  69.73 
 
 
619 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  66.33 
 
 
496 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  67.87 
 
 
624 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  66.74 
 
 
625 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  28.95 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  27.65 
 
 
435 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  28.2 
 
 
445 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.97 
 
 
628 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.56 
 
 
456 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.91 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  28 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  29.37 
 
 
444 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.9 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.75 
 
 
487 aa  93.6  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  25.58 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  25.16 
 
 
525 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.7 
 
 
431 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.05 
 
 
492 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.31 
 
 
484 aa  86.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.23 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  24.55 
 
 
470 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 
469 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.46 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.84 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.66 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.43 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 
578 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.49 
 
 
494 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
494 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.11 
 
 
532 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  28.02 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  23.43 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.12 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.5 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.48 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  29.37 
 
 
463 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.68 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.57 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  24.11 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  26.8 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.37 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.19 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  26.27 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.8 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  25.77 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.73 
 
 
1199 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.3 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  24.12 
 
 
510 aa  67  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.07 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  24.44 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.39 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  29.87 
 
 
422 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.46 
 
 
1274 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  26.83 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  27.08 
 
 
435 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.35 
 
 
493 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.32 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.8 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.32 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.9 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.9 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  24.64 
 
 
503 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  25.28 
 
 
454 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  26.39 
 
 
353 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  26.26 
 
 
499 aa  60.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  23.76 
 
 
456 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.78 
 
 
493 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.78 
 
 
493 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.51 
 
 
482 aa  60.1  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  28.42 
 
 
624 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  26.85 
 
 
507 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  24.34 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.32 
 
 
496 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 
490 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.2 
 
 
533 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  30.23 
 
 
474 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.8 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  26.05 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  23.81 
 
 
478 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.72 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.68 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  22.04 
 
 
537 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  24.72 
 
 
528 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  27.49 
 
 
535 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  24.5 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.85 
 
 
426 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  22.02 
 
 
516 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.47 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.47 
 
 
487 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.47 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  24.07 
 
 
480 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.08 
 
 
462 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>